排毒瑜伽主要針對腸道，淋巴系統和消化系統牽涉很多伸展、轉腰的動作，有助於排除身體不必要的物質，更可透過扭轉和彎曲等姿勢，按摩及刺激部分具排毒功能的器官，有助促進腸道蠕動，令宿便等身體毒素更易排走 。